Projet dédié à la gestion, au stockage et à l'analyse de données biologiques et scientifiques via des outils comme OMERO et iRods. Il permet aux laboratoires et équipes de recherche de déployer des infrastructures sécurisées pour héberger, organiser et partager leurs données tout en garantissant leur intégrité et leur accessibilité. Le projet inclut également des mécanismes d'authentification avancés et des solutions de sauvegarde automatisée.

Le projet biotools est un ensemble de scripts Perl dédiés à l'analyse et la gestion de données biologiques. Il permet d'automatiser des workflows de laboratoire et de faciliter le traitement de données de recherche en biologie.

BioMAJ est un outil dédié à la gestion et à la synchronisation des banques de données biologiques. Il permet d'automatiser les processus de téléchargement, de mise à jour et d'installation des données, garantissant ainsi leur cohérence et leur accessibilité pour les utilisateurs. Idéal pour les laboratoires et les centres de recherche, il simplifie la maintenance des ressources biologiques.

Ce projet permet de construire et distribuer des paquets conda dédiés à IntronSeeker, une suite logicielle orientée vers l'analyse de données biologiques. Il facilite l'installation et la gestion des dépendances pour les utilisateurs de cette plateforme, en automatisant le processus de build et de publication des paquets.

Le projet Cluster est une plateforme dédiée à l'analyse de données biologiques. Il permet la gestion de workflows de recherche et l'automatisation de tâches de laboratoire, offrant ainsi une solution complète pour les chercheurs en biologie.

Outil complet pour automatiser les soumissions de données biologiques vers des bases de données publiques comme l'ENA (European Nucleotide Archive) et BioSamples. Il simplifie la gestion des métadonnées d'échantillons, la création de projets génomiques et la soumission de séquences brutes. Chaque module fonctionne de manière indépendante pour répondre à des besoins spécifiques tout en s'intégrant dans un workflow unifié.

Osiris est un système informatique dédié à la gestion et au suivi d'échantillons biologiques dans un environnement de laboratoire. Il permet de centraliser les données, de faciliter la communication entre les équipements et les utilisateurs, et d'automatiser certaines tâches de traitement et d'analyse. Le projet vise à optimiser la traçabilité et l'efficacité des processus scientifiques.

BLISS est une plateforme logicielle open source conçue pour la gestion et le contrôle d'équipements scientifiques, notamment dans les environnements de recherche comme les synchrotrons. Elle permet d'automatiser des processus expérimentaux, de superviser des instruments de laboratoire et d'analyser des données en temps réel pour faciliter les recherches avancées en physique, chimie ou biologie.

Solution d'installation de base pour Ubuntu et Debian dédiée à la bioinformatique. Elle permet de configurer rapidement des environnements scientifiques avec des gestionnaires de paquets spécialisés (Conda, Mamba), des outils de conteneurisation (Docker) et des solutions d'automatisation (Ansible). Destinée aux chercheurs et équipes travaillant sur des données biologiques, elle facilite la reproductibilité et la sécurité des infrastructures.