MetExplore 3 Java est une plateforme dédiée à l'analyse et à l'exploration des réseaux métaboliques. Elle permet aux chercheurs et biologistes de charger, visualiser et analyser des données issues de bases de données biologiques comme KEGG ou ChEBI. L'outil facilite l'intégration de réseaux métaboliques, la comparaison de voies métaboliques et la gestion de collections de données pour des études en métabolomique et biologie des systèmes.

Outil permettant de sélectionner et rechercher des taxonomies issues de la base de données NCBI. Il facilite la navigation dans les hiérarchies taxonomiques et l'identification des taxons par leur nom. Destiné aux chercheurs et applications nécessitant une gestion structurée des classifications biologiques.

Outil complet pour automatiser les soumissions de données biologiques vers des bases de données publiques comme l'ENA (European Nucleotide Archive) et BioSamples. Il simplifie la gestion des métadonnées d'échantillons, la création de projets génomiques et la soumission de séquences brutes. Chaque module fonctionne de manière indépendante pour répondre à des besoins spécifiques tout en s'intégrant dans un workflow unifié.

Ce projet consiste en la curation et la gestion d'une base de données dédiée aux algues rouges (Rhodophyta), incluant des séquences génétiques (rbcl) et des métadonnées associées. Il vise à centraliser et structurer des données scientifiques pour faciliter la recherche en biologie marine et en systématique végétale. Les données sont organisées, vérifiées et documentées pour une utilisation par la communauté scientifique.

Djangorestframework-spore est un projet basé sur Django REST Framework, permettant la gestion et l'analyse de données biologiques, plus spécifiquement de séquences d'ADN. Il offre des fonctionnalités telles que la recherche de gènes, l'annotation de séquences et la visualisation des résultats.

BioWeb est une plateforme dédiée à la gestion et au catalogage de ressources bioinformatiques. Elle permet aux chercheurs, institutions et professionnels de la biologie de référencer, organiser et partager des outils, logiciels et bases de données spécialisés dans le domaine de la bioinformatique. L'objectif est de faciliter l'accès à ces ressources et d'améliorer la collaboration entre les acteurs du secteur.

Solution d'installation de base pour Ubuntu et Debian dédiée à la bioinformatique. Elle permet de configurer rapidement des environnements scientifiques avec des gestionnaires de paquets spécialisés (Conda, Mamba), des outils de conteneurisation (Docker) et des solutions d'automatisation (Ansible). Destinée aux chercheurs et équipes travaillant sur des données biologiques, elle facilite la reproductibilité et la sécurité des infrastructures.