Ce projet propose un tutoriel pour apprendre à utiliser Nextflow, un outil de gestion de workflows pour les analyses bioinformatiques. Il permet aux utilisateurs de comprendre comment créer et exécuter des pipelines de traitement de données biologiques de manière reproductible et scalable.

Conférence sur la gestion de version et la recherche reproductible, présentant les enjeux et les outils pour une collaboration efficace et une reproductibilité des résultats en recherche.

Solution d'installation de base pour Ubuntu et Debian dédiée à la bioinformatique. Elle permet de configurer rapidement des environnements scientifiques avec des gestionnaires de paquets spécialisés (Conda, Mamba), des outils de conteneurisation (Docker) et des solutions d'automatisation (Ansible). Destinée aux chercheurs et équipes travaillant sur des données biologiques, elle facilite la reproductibilité et la sécurité des infrastructures.

Metabo est une application dédiée à la gestion et au suivi des échantillons utilisés dans le cadre d'expérimentations en métabolomique. Elle permet aux chercheurs et laboratoires de centraliser, organiser et analyser les données liées à leurs échantillons biologiques, facilitant ainsi la traçabilité et la reproductibilité des expériences scientifiques.