Annuaire des initiatives

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  • Plugin Maven dédié à la gestion des extensions et au déploiement du logiciel Icy, une plateforme open source d'analyse d'images biologiques. Il permet de valider les versions des dépendances, de construire et déployer des extensions pour Icy, tout en assurant la compatibilité avec les outils développés par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur.
  • Ce projet fournit des plugins et outils pour Squash TM, une plateforme open source dédiée à la gestion des tests logiciels. Il permet aux équipes de définir, suivre et valider les exigences métiers, de planifier les jalons de test, d'exporter des rapports détaillés et d'analyser les risques liés aux projets. Les fonctionnalités incluent la génération de documents, la gestion des cas de test et l'intégration avec des outils de reporting.
  • Ce plugin Maven facilite la gestion, le déploiement et la maintenance des extensions du logiciel Icy, dédié à l'analyse d'images biologiques. Il automatise les processus de build et de déploiement pour les outils développés par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, permettant aux chercheurs de se concentrer sur l'innovation plutôt que sur les aspects techniques de la compilation et de la distribution.
  • Ce projet développe un plugin pour la bibliothèque LImA, permettant le contrôle et l'acquisition d'images à partir de détecteurs Quantum Xspress3. Il s'agit d'une solution logicielle dédiée à la gestion unifiée de caméras 2D, principalement utilisée dans des environnements scientifiques comme les synchrotrons. Le plugin facilite la configuration des paramètres d'acquisition, la sauvegarde des données et l'intégration avec d'autres outils de traitement d'images.
  • Ce projet développe un plugin pour la bibliothèque LImA, permettant le contrôle et l'acquisition d'images à partir de caméras Frelon. Il s'agit d'une solution logicielle open source conçue pour les environnements scientifiques nécessitant une gestion précise des paramètres d'acquisition, comme le temps d'exposition, le déclenchement externe ou la synchronisation des détecteurs. Le plugin facilite l'intégration de ces caméras dans des systèmes d'imagerie avancés.
  • BlockVars est une extension pour le logiciel Icy, dédié à l'analyse d'images biologiques. Ce plugin propose des outils pour simplifier la gestion des variables couramment utilisées dans les protocoles de bioanalyse. Il permet de définir et manipuler des dimensions, des points et des rectangles, facilitant ainsi la création et l'exécution de workflows automatisés. Développé par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, il s'intègre parfaitement dans l'écosystème Icy pour répondre aux besoins des chercheurs en imagerie cellulaire et moléculaire.
  • Bibliothèque partagée dédiée à la gestion centralisée des logs pour les logiciels d'analyse d'images biologiques, notamment Icy et ses plugins. Elle facilite la standardisation des messages de débogage, améliore la traçabilité des erreurs et simplifie la maintenance des applications scientifiques en fournissant des outils de configuration et de visualisation adaptés aux besoins des développeurs et des utilisateurs.
  • Ce projet développe un plugin pour le contrôle et l'acquisition d'images à partir de caméras QHYccd dans le cadre du projet LImA. LImA est une bibliothèque logicielle open source conçue pour standardiser la gestion des détecteurs 2D, permettant aux utilisateurs de configurer des paramètres d'acquisition, de sauvegarder des images et d'effectuer des traitements basiques. Le plugin facilite l'intégration de ces caméras spécifiques dans des environnements scientifiques ou industriels.
  • Ce projet permet de contrôler et automatiser des équipements optiques et scientifiques via une interface logicielle. Il facilite la réalisation de mesures expérimentales en laboratoire en offrant des outils pour configurer, lancer et analyser des protocoles. Compatible avec divers instruments, il s'intègre dans des environnements de recherche ou industriels nécessitant une gestion précise de dispositifs optiques.
  • ROI Tagger est une extension pour le logiciel d'analyse d'images biologiques Icy, développée par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur. Elle permet aux chercheurs et biologistes de créer et d'appliquer des étiquettes (tags) sur des régions d'intérêt (ROI) dans des images microscopiques. Les tags sont enregistrés directement dans les séquences d'images, assurant une traçabilité et une réutilisation des annotations. L'outil facilite l'organisation et l'analyse des données visuelles en intégrant des fonctionnalités de gestion multi-tags et de compatibilité avec d'autres plugins comme Spot Detector.

26 initiatives