Ce projet fournit des supports de tutoriels pour Snakemake, un outil de gestion de workflows bioinformatiques. Les tutoriels sont adaptés pour être exécutés sur la plateforme bioinformatique Genotoul en utilisant Conda et Singularity. Le projet inclut des slides, des tutoriels courts et longs, ainsi que des liens vers la documentation officielle et d'autres ressources utiles.

Ce projet fournit un dépôt de code source contenant des modules Snakemake réutilisables et interopérables, permettant l'automatisation de workflows bioinformatiques et la gestion de pipelines de données.

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Guix est un gestionnaire de paquets et un environnement d'exécution qui permet la création de pipelines bioinformatiques reproductibles. Il permet de gérer les dépendances logicielles pour l'analyse génomique, facilitant ainsi le partage et la réutilisation des workflows.