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Pertinence
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- Outil spécialisé dans l'imputation et l'analyse de données génétiques. Il permet de traiter des données brutes pour corriger les erreurs, imputer les valeurs manquantes et identifier les segments génomiques étrangers. Utilisé principalement dans le domaine de la génétique des populations et de la cartographie génétique, il facilite la détection de recombinaisons et l'estimation des fréquences alléliques.
- NOISYmputer est un outil spécialisé dans le traitement de données génomiques de type LC-NGS. Il permet d'imputer les données manquantes, de corriger les erreurs et de typer précisément les régions chromosomiques hétérozygotes. Basé sur des estimations de maximum de vraisemblance, il identifie également les points de recombinaison génétique, éliminant ainsi le besoin de pré-filtrage complexe des données bruitées.
- Package R pour la sélection génomique de lignées de blé, contenant des fonctions pour le calcul de la matrice de relation additive, la sélection de marqueurs, la réduction de la taille de la population d'entraînement, l'imputation de données manquantes, la simulation de QTL et la prédiction de la valeur génétique.
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