Ce projet automatise l'indexation et le contrôle qualité des génomes et annotations génétiques. Il génère des index nécessaires aux outils d'analyse en aval, évalue la qualité des assemblages génomiques via des métriques comme la complétude (BUSCO) et la contiguïté (QUAST), et produit des rapports détaillés pour faciliter la comparaison et le suivi des données génomiques. Destiné aux chercheurs et institutions en biologie moléculaire.

Librairie et suite logicielle dédiée à l'indexation et à l'analyse de k-mers (séquences courtes) issus de données de séquençage biologique haut débit. Elle permet de traiter de grands volumes de séquences génomiques en utilisant le protocole MPI pour une distribution efficace des calculs sur des clusters de machines. Les résultats peuvent être exploités pour des études génomiques, métagénomiques ou épidémiologiques.