Le projet Biosphere Shiny App permet aux utilisateurs de déployer des applications Shiny et des environnements R sur l'infrastructure cloud de l'IFB (Institut Français de Bioinformatique). Il offre une interface web pour accéder à des applications interactives développées en R, facilitant ainsi la visualisation de données et les analyses statistiques dans le domaine de la bioinformatique. Les utilisateurs peuvent choisir parmi différents environnements R ou déployer leurs propres applications.

Ce projet permet de déployer des serveurs Galaxy personnalisés sur l'infrastructure cloud de l'IFB (Institut Français de Bioinformatique). Il offre un environnement accessible et reproductible pour la recherche computationnelle en bioinformatique, incluant des outils et des banques de données adaptables. Les utilisateurs peuvent configurer leur instance Galaxy selon leurs besoins spécifiques, que ce soit via Docker ou Ansible.

La Biosphere Shiny App permet aux utilisateurs de déployer des applications web interactives basées sur R (Shiny) sur l'infrastructure cloud de l'IFB. Elle offre un environnement personnalisable avec des stacks Docker préconfigurées (Rocker) pour faciliter le développement et le partage d'outils bioinformatiques. Les utilisateurs peuvent choisir parmi des versions de R, des packages spécifiques (comme tidyverse) ou déployer leurs propres applications depuis des dépôts Git publics.

Le projet Biosphere Galaxy App permet de déployer des serveurs Galaxy personnalisés sur l'infrastructure cloud de l'IFB. Il offre un environnement de calcul bioinformatique ouvert, reproductible et transparent, accessible via une interface web. Les utilisateurs peuvent configurer leur instance Galaxy avec des piles logicielles spécifiques, des banques de données et des outils adaptés à leurs besoins de recherche. L'outil facilite la collaboration et le partage de données dans le domaine de la biologie computationnelle.

Le projet Biosphere Galaxy App permet de déployer des serveurs Galaxy personnalisés sur l'infrastructure cloud de l'IFB. Il offre un environnement dédié à la recherche computationnelle accessible, reproductible et transparente, incluant des outils bioinformatiques et des bases de données biologiques. Les utilisateurs peuvent configurer leur instance Galaxy selon leurs besoins en choisissant des versions spécifiques, des outils et des banques de données.

WAW (Workflow Application Wrapper) is a framework for automatic generation of workflows. It allows users to generate a workflow and its execution environment, and use it with or without a graphical interface on various infrastructures (personal machine, server, cluster, cloud, etc.). The framework includes 100 bioinformatics application bricks that can be assembled to create a wide variety of analysis workflows. It is built on existing technologies such as Snakemake, Docker, R Shiny, conda, and MultiQC.