Outil dédié à l'amélioration de la qualité du code logiciel par le biais de revues collaboratives automatisées. Il permet aux équipes de développement de partager, analyser et améliorer leur code de manière structurée et efficace. Intégré à des environnements de travail existants, il optimise les processus de validation et de feedback pour accélérer les cycles de développement.

GeoPF est un outil de factorisation de Poisson géographique conçu pour analyser et prédire les préférences des utilisateurs en intégrant des données géolocalisées et des réseaux sociaux. Il permet de modéliser les interactions entre utilisateurs et éléments (comme des produits ou lieux) pour générer des recommandations personnalisées. Le système prend en compte des facteurs sociaux et des biais locaux pour affiner ses prédictions.

BenedicteSDK est un framework qui permet d'intégrer un module conversationnel dans une application iOS. Il fournit tous les modèles et outils pour créer et gérer un module conversationnel, avec une connexion possible par le biais d'un AccessToken et une gestion des messages par le biais d'un manager.

Le Bioimaging Desktop est une plateforme dédiée à l'analyse et à la visualisation d'images biologiques et microscopiques. Elle fournit aux chercheurs et scientifiques des outils spécialisés pour manipuler, analyser et interpréter des données d'imagerie issues de divers domaines comme la biologie cellulaire, la pathologie numérique ou la bioinformatique. Intégrée à l'écosystème Biosphère, elle facilite la gestion et le partage de données d'imagerie complexes.

BioPipes est une application dédiée à la bioinformatique qui propose un environnement standardisé pour exécuter des pipelines d'analyse de données biologiques. Elle intègre des outils comme Nextflow, Snakemake et CWLTool, ainsi que des gestionnaires de paquets (Conda/Mamba) configurés avec des canaux spécialisés (R, bioconda, conda-forge). L'application facilite le déploiement et la gestion des outils nécessaires aux chercheurs en biologie, en offrant une solution clé en main pour leurs besoins computationnels.

Ce projet est une bibliothèque de logiciels de transcription de la parole en texte, divisée en deux parties : la personnalisation du modèle acoustique (AM) et l'adaptation du modèle linguistique (LM). La personnalisation du modèle acoustique est principalement pertinente pour une bibliothèque précédente, sauf pour l'extraction des embeddings d'accent. Dans cette version, les embeddings proposés sont obtenus à partir de tous les échantillons précédents d'un utilisateur particulier. Cette version fournit également une structure de code plus raffinée. L'adaptation du modèle linguistique définit des directives complètes pour la version finale de la personnalisation STT dans COMPRISE. Elle contient des stratégies de personnalisation pour l'adaptation du modèle linguistique et les principaux composants sont conçus pour correspondre aux outils et binaires intégrés Kaldi spécifiquement.

Ce projet vise à intégrer des jeux de données de biologie végétale et des outils d'évaluation dans PubAnnotation, une plateforme d'annotation de texte. Cela permettra une analyse plus poussée des données et une évaluation de leur qualité, facilitant ainsi la recherche dans le domaine de la biologie végétale.

Le projet bioinfo-utils fournit des outils pour l'analyse et le traitement de données biologiques, y compris la génération de rapports d'analyse et l'intégration avec des workflows de bioinformatique.

Extension logicielle dédiée à l'analyse d'images biologiques, intégrée à la plateforme Icy. Elle permet de calculer des enveloppes convexes pour des ensembles de points en deux ou trois dimensions. Utilisée principalement en imagerie médicale et en bioinformatique, elle facilite la modélisation géométrique et l'analyse de structures biologiques complexes. Développée par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, elle s'intègre comme un outil complémentaire pour les chercheurs et biologistes.

Plugin open source pour le logiciel Icy dédié à l'analyse d'images biologiques. Il permet aux chercheurs et biologistes de manipuler des matrices numériques et d'effectuer des calculs avancés directement dans l'environnement Icy. Développé par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, il s'intègre aux outils de bio-imagerie pour faciliter la recherche en biologie cellulaire et moléculaire.