Bibliothèque Rust dédiée à l'accélération de la lecture et de l'écriture de fichiers CSV en exploitant les instructions SIMD. Conçue pour traiter rapidement de grands volumes de données tabulaires, elle offre des lecteurs et écrivains optimisés pour des cas d'usage exigeants en performance, comme l'analyse de données massives ou le traitement en temps réel. Moins flexible que des solutions classiques, elle privilégie la vitesse au détriment de certaines fonctionnalités avancées.

Ce projet pédagogique vise à enseigner l'utilisation des collections en Kotlin à travers des exercices pratiques. Les étudiants manipulent des listes, ensembles et tableaux pour stocker, trier et analyser des données comme des pays avec leurs caractéristiques (nom, capitale, continent, population, superficie). Les exercices couvrent aussi la lecture de fichiers CSV et la génération de données aléatoires uniques.

AllMine est un outil d'analyse de données de séquençage permettant le minage d'allèles à partir de régions d'intérêt spécifiées. Il prend en charge les séquençages d'ADN et d'ARN, paired ou single end, avec une longueur de lecture maximale de 350bp. Les données de séquençage doivent être au format fastq et peuvent être compressées en gzip. Un fichier CSV décrivant les échantillons, une référence génomique au format fasta et une annotation au format gff ou gtf sont nécessaires pour l'exécution d'AllMine.