Outil dédié à la construction, l'annotation et la visualisation de graphes de séquences génomiques ou transcriptomiques. Permet aux chercheurs et biologistes de manipuler des données complexes sous forme de graphes, d'appliquer des filtres et des actions pour extraire des informations pertinentes, et de sauvegarder des états de visualisation pour une analyse collaborative ou répétée.

Gfatools est un ensemble d'outils dédiés à la manipulation de graphes de séquences au format GFA ou rGFA. Il permet de parser ces fichiers, d'extraire des sous-graphes et de convertir les données vers des formats comme FASTA ou BED. Ces fonctionnalités facilitent l'analyse et le traitement des données génomiques pour les chercheurs et bioinformaticiens.

Libhts est une bibliothèque Python et un ensemble d'outils dédiés au traitement et à l'analyse de données issues du séquençage haut débit. Elle permet aux chercheurs et bioinformaticiens de manipuler, convertir et visualiser des données génomiques complexes comme les fichiers BAM ou BigWig. L'outil facilite l'extraction de régions spécifiques, la génération de visualisations graphiques et l'automatisation de workflows pour des analyses génomiques avancées.

Outil dédié à l'analyse génomique utilisant des graphes de variations pour le génotypage et le mappage de données génétiques. Permet de représenter et manipuler des structures de données complexes issues de séquençage haut débit. Utilisé principalement en recherche biomédicale et en génétique des populations pour étudier les variations génétiques et leurs impacts.