CAMISIM est un logiciel permettant de modéliser des distributions d'abondance de communautés microbiennes et de simuler des jeux de données de métagénomique correspondants. Il a été principalement développé pour le défi [Critical Assessment of Metagenome Annotation (CAMI)](http://microbiome-cosi.org/cami) mais devrait être adapté à un usage général. N'hésitez pas à [ouvrir un nouvel issue](https://github.com/CAMI-challenge/CAMISIM/issues) si vous rencontrez des problèmes ou avez besoin d'aide.

Ce projet vise à analyser et à comprendre la diversité et l'activité des communautés microbiennes marines à partir de l'étude de génomes bactériens et archéens. Il comprend la reconstruction de réseaux métaboliques, l'étude de la diversité et de l'activité des communautés, ainsi que la modélisation de l'impact des facteurs biotiques sur la structure de ces communautés.