Outil open source dédié à la modélisation et à la simulation de processus cellulaires complexes. Permet aux chercheurs et scientifiques de simuler des interactions biologiques, d'analyser des données expérimentales et de visualiser les résultats pour accélérer les découvertes en biologie cellulaire et en médecine.

Projet dédié à l'analyse et à la modélisation des exosomes, petites vésicules extracellulaires impliquées dans la communication cellulaire. Il permet d'étudier leur rôle dans divers processus biologiques et pathologiques, notamment pour identifier des biomarqueurs utiles au diagnostic ou à la recherche médicale. Les outils développés facilitent l'interprétation de données complexes issues de la biologie cellulaire.

EVIVALDI est un outil de simulation dédié à l'étude des systèmes microbiens et biologiques. Il permet de modéliser des processus complexes, d'analyser des données expérimentales et de visualiser les résultats de manière interactive. Le projet est particulièrement utile pour les chercheurs et les biologistes souhaitant comprendre et prédire le comportement de systèmes microbiens dans divers environnements.

Phylanim est un outil dédié à l'analyse et à la visualisation de données phylogénétiques. Il permet aux chercheurs et biologistes de modéliser des scénarios évolutifs, comparer des séquences génétiques et générer des arbres évolutifs interactifs. L'application facilite l'exploration des relations entre espèces et la simulation de processus biologiques complexes.

Projet dédié à l'application des principes de la physique dans le domaine médical. Il permet de modéliser et simuler des phénomènes physiques pour améliorer la compréhension des processus biologiques, optimiser les protocoles médicaux et analyser des données biomédicales. Les outils développés visent à soutenir la recherche et l'innovation en imagerie médicale et en diagnostic.

Outil dédié à l'analyse et à la modélisation de séquences, notamment pour les données biologiques ou temporelles. Permet de calculer des alignements, des distances, des probabilités, et de générer des visualisations comme des graphiques ou des tableaux. Utilisé pour étudier des phénomènes répétitifs, des chaînes de Markov, ou des processus de renouvellement dans divers domaines scientifiques.

GPy est un framework open source en Python dédié à la modélisation par processus gaussiens. Il permet aux chercheurs et data scientists de construire, analyser et optimiser des modèles prédictifs pour des données variées. Utilisé dans des domaines comme la biologie, la finance ou l'ingénierie, il facilite l'exploration de relations non linéaires et la prise de décision basée sur des données.

Ce projet est une bibliothèque Julia dédiée à la simulation, l'inférence statistique et la vérification de chaînes de Markov à temps continu. Il permet de modéliser des réseaux de réactions chimiques et des réseaux de Petri stochastiques, tout en offrant des méthodes d'approximation bayésienne pour l'analyse de systèmes dynamiques complexes. Les outils implémentés facilitent l'étude des processus stochastiques dans des domaines comme la biologie des systèmes ou la chimie computationnelle.

Ce projet permet d'analyser et de modéliser des relations bidirectionnelles entre entités à partir de données structurées. Il facilite la compréhension des interactions complexes dans des réseaux, comme les flux logistiques, les relations sociales ou les systèmes biologiques. L'outil génère des visualisations et des métriques pour identifier des motifs, optimiser des processus ou simuler des scénarios dynamiques. Il s'adresse aux chercheurs, ingénieurs ou analystes travaillant sur des données relationnelles.

Le projet ReactionDiffusion est un outil de simulation de réactions chimiques dans des milieux diffusifs. Il permet de modéliser des processus biologiques impliquant des réactions et diffusions, en utilisant une approche par éléments finis.