Projet metagenomics est un ensemble d'outils permettant le téléchargement et le nettoyage de données génomiques à partir de GenBank pour une analyse ultérieure. Il dépend de Python, BioPython et taxonkit.

MetagWGS est une pipeline d'analyse bioinformatique utilisant Nextflow pour le séquençage de génomes métagénomiques entiers. Il traite les données raw .fastq/.fastq.gz et/ou des assemblies (contigs) .fa/.fasta. Les modules du workflow comprennent le nettoyage et le filtrage des séquences, l'assemblage, l'annotation structurale et fonctionnelle des gènes.