RedOak est un logiciel libre et open source conçu pour indexer et analyser de grandes collections de génomes similaires. Il permet une approche sans alignement ni référence, facilitant l'étude des séquences génomiques, la détection de motifs communs ou spécifiques, et l'optimisation des ressources de stockage. Utilisable en bioinformatique, il s'adresse aux chercheurs et institutions travaillant sur des données génomiques.