MBMA est un outil d'analyse de microbiotes basé sur la cartographie génétique. Il permet d'identifier et de quantifier avec précision les espèces, souches et gènes de résistance présents dans des échantillons métagénomiques. Grâce à une base de données optimisée et des méthodes avancées de comptage et d'appel de variants, MBMA réduit les faux positifs et améliore la sensibilité des analyses. Il propose trois modes de fonctionnement adaptés à différents besoins : cartographie simple, cartographie avec appel de variants, et modes prédéfinis pour les espèces bactériennes ou les gènes de résistance.