ROI Tagger est une extension pour le logiciel d'analyse d'images biologiques Icy, développée par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur. Cet outil permet aux chercheurs et biologistes de créer, gérer et appliquer des étiquettes (tags) sur des régions d'intérêt (ROI) dans des images microscopiques. Les annotations sont sauvegardées directement dans les séquences, garantissant leur persistance et leur réutilisation. Compatible avec d'autres plugins comme Spot Detector, il facilite l'organisation et l'analyse des données visuelles en biologie.

Outil dédié à la gestion et à l'organisation de collections biologiques et de données taxonomiques. Il permet aux chercheurs et institutions de structurer, valider et partager des informations scientifiques tout en facilitant la collaboration et la traçabilité des données.

ROI Tagger est une extension pour le logiciel d'analyse d'images biologiques Icy, développée par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur. Elle permet aux chercheurs et biologistes de créer et d'appliquer des étiquettes (tags) sur des régions d'intérêt (ROI) dans des images microscopiques. Les tags sont enregistrés directement dans les séquences d'images, assurant une traçabilité et une réutilisation des annotations. L'outil facilite l'organisation et l'analyse des données visuelles en intégrant des fonctionnalités de gestion multi-tags et de compatibilité avec d'autres plugins comme Spot Detector.

Projet dédié à la gestion, au stockage et à l'analyse de données biologiques et scientifiques via des outils comme OMERO et iRods. Il permet aux laboratoires et équipes de recherche de déployer des infrastructures sécurisées pour héberger, organiser et partager leurs données tout en garantissant leur intégrité et leur accessibilité. Le projet inclut également des mécanismes d'authentification avancés et des solutions de sauvegarde automatisée.

Thaliadb est une plateforme dédiée à la gestion, l'analyse et la visualisation de données biologiques et génétiques. Elle permet aux chercheurs et scientifiques de stocker, organiser et exploiter des jeux de données complexes. L'outil facilite la collaboration entre équipes en offrant des fonctionnalités avancées d'analyse et de représentation graphique, tout en assurant la sécurité et l'intégrité des données.

OMERO est une plateforme open source dédiée à la gestion, au partage et à l'analyse d'images scientifiques et biologiques. Elle permet aux chercheurs de stocker, organiser et visualiser des données d'imagerie complexe, facilitant ainsi la collaboration et l'interprétation des résultats dans des domaines comme la biologie cellulaire ou la médecine.

Ce projet consiste en la curation et la gestion d'une base de données dédiée aux algues rouges (Rhodophyta), incluant des séquences génétiques (rbcl) et des métadonnées associées. Il vise à centraliser et structurer des données scientifiques pour faciliter la recherche en biologie marine et en systématique végétale. Les données sont organisées, vérifiées et documentées pour une utilisation par la communauté scientifique.

Formation organisée par des organismes publics (CNRS, France BioImaging, EMBRC-France) pour enseigner l'utilisation d'OMERO, un système de gestion d'images biologiques. Les participants apprennent à importer, visualiser, annoter et partager des données d'imagerie scientifique tout en respectant les principes FAIR (Faciles à trouver, Accessibles, Interopérables, Réutilisables).

Metabase est une plateforme dédiée à la gestion et à l'analyse de données issues de manipulations de laboratoire, notamment en biologie moléculaire et en séquençage génétique. Elle permet aux chercheurs de centraliser, organiser et visualiser des informations complexes comme les échantillons, les extractions, les amplifications et les résultats de séquençage. L'outil facilite le suivi des expériences, la collaboration entre équipes et la génération de rapports détaillés pour des analyses scientifiques approfondies.

NMFProfiler est un outil dédié à l'intégration de données multi-omiques pour des échantillons organisés en groupes. Il permet d'identifier et de visualiser des signatures moléculaires distinctes entre les groupes, facilitant ainsi l'analyse comparative des profils biologiques. L'outil génère des matrices de contribution et des visualisations graphiques pour interpréter les résultats, aidant les chercheurs à comprendre les différences sous-jacentes entre les échantillons.