Ce projet, nommé rennes, est une collection d'outils et de simulations dédiés aux systèmes dynamiques et à l'analyse géométrique. Il inclut des bibliothèques MATLAB pour le développement et le débogage, ainsi que des démonstrations et exemples d'utilisation.

Ce projet consiste en une analyse de données de bioreacteurs et une simulation de dynamiques bactériennes à l'aide de modèles stochastiques différentiels. Les données brutes sont traitées pour obtenir des informations pertinentes dans des fichiers Matlab individuels, qui sont ensuite utilisés pour paramétrer les modèles et simuler les dynamiques en fonction de la séquence lumineuse. Le projet a été développé en Python et Matlab et nécessite des outils tels que Pandas, Numpy, Matplotlib, Seaborn, SciPy, SciKit et le statistics toolbox de Matlab.

Ce guide est publié sous licence GPLv3 et Open License 2.0 et est destiné à être enrichi par des professionnels. Il est divisé en 16 feuilles thématiques qui couvrent les besoins des développeurs à chaque étape de leur projet, de la préparation du développement à l'utilisation des analyses.