I2masschroq est un logiciel dédié à la quantification de protéines et à l'analyse de spectrométrie de masse. Il permet le traitement de données de protéomique et la gestion de données de spectrométrie de masse. Il est distribué sous la licence GNU General Public License.

Le logiciel beads permet l'analyse d'images de gels d'électrophorèse 2-D en détectant et en quantifiant les taches présentes sur ces images. Il est utilisé pour la reconnaissance de motifs sur des images de gels, ce qui permet d'identifier et de quantifier les protéines présentes dans l'échantillon.