L'ontologie BioAGgressor (BAGO) est un outil sémantique développé pour modéliser les organismes vivants impliqués dans l'apparition de maladies des plantes cultivées. Elle permet de structurer et d'interconnecter des données sur les bioagresseurs (ravageurs, pathogènes, etc.) et leurs interactions avec les cultures, facilitant ainsi leur identification, leur classification et leur gestion. BAGO est utilisée pour enrichir des bulletins de santé végétale et soutenir la recherche agronomique.

Ce projet accompagne une publication scientifique visant à développer un cadre de travail pour résoudre des problèmes inverses en biologie. Il utilise des données de capteurs de phéromones pour détecter la présence d'insectes ravageurs dans les cultures. Le code permet de simuler la propagation des phéromones, d'optimiser la localisation des sources d'émission et de générer des cartes de présence d'insectes. Les résultats sont présentés sous forme de figures et de données exploitables pour la recherche agronomique.

Outil d'analyse géospatiale dédié au traitement des données du Registre Parcellaire Graphique (RPG) français. Il permet aux agronomes et géomaticiens d'étudier les séquences de parcelles agricoles pour identifier les rotations culturales, les changements d'usage des sols et la dynamique des prairies permanentes. Développé par l'INRAE et l'UMR SADAPT, il facilite la recherche agronomique et l'aide à la décision publique en matière de gestion des terres agricoles.

CNW-Grass est un modèle fonctionnel de structure végétale (FSPM) dédié à l'étude des graminées. Il simule la croissance des plantes en intégrant la morphogenèse, le métabolisme du carbone et de l'azote, ainsi que les flux d'eau. Le modèle prend en compte des paramètres pédoclimatiques (température, lumière, humidité, CO2, etc.) pour prédire le développement des organes végétaux, la photosynthèse, la transpiration et la sénescence. Il est utilisé en recherche agronomique pour optimiser les pratiques culturales et comprendre les interactions entre croissance végétale et environnement.

OpenAlea.Adel est un outil de modélisation et de simulation dédié à l'étude du développement architectural des plantes graminées. Il permet de reproduire en 3D la croissance et la morphologie des plantes, facilitant ainsi la recherche agronomique et l'analyse des interactions entre génétique et environnement. Les modèles intégrés, comme Adel-Maize et Adel-Wheat, aident à comprendre les mécanismes de développement végétal et à optimiser les pratiques culturales.