Annuaire des initiatives
Pertinence
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- PLMdetect est un outil développé depuis 2010 permettant la détection de motifs sur-représentés à une distance spécifique du site de démarrage ou d'arrêt de la transcription dans des séquences d'ADN. Il a été utilisé dans plusieurs études pour l'analyse de régions promotrices de gènes et la recherche de motifs impliqués dans la régulation de la transcription.
- DiphtOscan est un outil en ligne de commande écrit en Python, permettant d'analyser des assemblages génomiques de Corynebacterium diphtheriae et d'autres espèces du complexe Corynebacterium diphtheriae species complex (CdSC). Il permet de rechercher des espèces, des gènes associés aux biovars, des facteurs de virulence, des déterminants de résistance aux antimicrobiens, des intégrons et de construire des arbres phylogénétiques.
- Le projet spot_ICE permet l'analyse de gènes bactériens et la recherche de systèmes de transfert de gènes via une interface graphique interactive. Il prend en entrée des fichiers contenant des informations sur les gènes et les spots entre les gènes core, et affiche les résultats sous forme de graphiques.
- Ce projet vise à analyser la méthylation de l'ADN chez les poulets stressés en utilisant des données de séquençage de bisulfite. Il comprend des scripts et des pipelines pour le prétraitement des données, la recherche de différences de méthylation entre échantillons et l'analyse de l'expression des gènes.
- Ce site est la plateforme numérique de la médiathèque de Genlis, offrant aux habitants un accès en ligne à son catalogue de livres, films, CD et autres supports. Les utilisateurs peuvent rechercher, réserver et prolonger leurs emprunts, consulter des sélections thématiques, accéder à des ressources numériques (presse, formations, vidéos) et découvrir les animations culturelles proposées. Un espace personnel permet de gérer son compte et ses prêts.
- EFASTA est un programme en ligne de commande écrit en Java qui permet d'extraire un segment nucléotidique (par exemple, une région, un ORF, un CDS) à partir d'un fichier FASTA. Il offre la possibilité de rechercher des gènes dans des séquences nucléotidiques et de traduire ces séquences en acides aminés.
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