Projet de recherche en génomique visant à étudier les hotspots de recombinaison indépendants du gène Prdm9 chez les mammifères placentaires. Il permet d'analyser des données génomiques (séquençage, cartes de déséquilibre de liaison) pour comparer des espèces et identifier des motifs évolutifs. Les résultats sont utilisés pour comprendre les mécanismes de recombinaison et leur impact sur la diversité génétique.

BPM est un logiciel spécialisé dans la recherche exacte de motifs génétiques dans l'ADN. Il permet d'indexer des milliers de motifs génétiques pour les retrouver rapidement dans des génomes complets. L'outil est optimisé pour traiter des génomes bactériens en moins d'une seconde, même avec des centaines de milliers de motifs à rechercher. Il est particulièrement utile pour l'analyse génomique, la détection d'allèles ou la comparaison de séquences.

Genometools est un projet dédié à l'analyse de données génomiques. Il permet l'identification de variations génétiques et la recherche de motifs dans des séquences d'ADN, offrant ainsi des fonctionnalités clés pour la recherche en génomique.

Outil dédié à l'analyse de séquences biologiques pour identifier des consensus moléculaires. Permet de comparer des données génétiques et d'extraire des motifs communs entre plusieurs séquences. Utilisé principalement dans le domaine de la bioinformatique pour faciliter la recherche et l'interprétation de données génomiques.

Ce projet propose des outils pour identifier et analyser des motifs probabilistes spécifiques dans les séquences génomiques, notamment les matrices de poids de position di-nucléotidiques (di-PWMs). Il permet de rechercher ces motifs dans des séquences ADN contenant des symboles non standards (IUPAC), facilitant ainsi l'étude des régulations génétiques et des interactions moléculaires.