Le projet acarre-envpasteur est un dépôt de code source contenant un environnement de développement pour la recherche en biologie. Il permet l'analyse de données biologiques et la recherche sur les maladies infectieuses en utilisant des algorithmes de machine learning. Ce dépôt contient un fichier de recette Singularity pour construire une image contenant tous les outils nécessaires à ces tâches.

Ce projet vise à intégrer des jeux de données de biologie végétale et des outils d'évaluation dans PubAnnotation, une plateforme d'annotation de texte. Cela permettra une analyse plus poussée des données et une évaluation de leur qualité, facilitant ainsi la recherche dans le domaine de la biologie végétale.

Biopython est un ensemble d'outils écrits en Python pour la biologie computationnelle. Il permet l'analyse et la manipulation de données biologiques, telles que des séquences d'ADN ou de protéines, et est utilisé dans la recherche en bioinformatique. Le projet fournit également des fonctionnalités pour le développement d'outils dans ce domaine.

Le projet biotools est un ensemble de scripts Perl dédiés à l'analyse et la gestion de données biologiques. Il permet d'automatiser des workflows de laboratoire et de faciliter le traitement de données de recherche en biologie.

Le plugin Timestamp Overlay est un outil développé pour le logiciel d'analyse d'images biologiques Icy. Il permet d'afficher un tampon temporel personnalisable sur une séquence 2D. Ce plugin est utilisé dans le cadre de recherches en biologie pour l'annotation et le suivi temporel d'images biologiques.

MorphoNet est un navigateur web innovant permettant de visualiser et d'interagir avec des ensembles de données morphodynamiques complexes, avec des applications dans la recherche et l'enseignement. MorphoNet offre un large éventail d'interactions pour explorer la structure, la dynamique et la variabilité des formes biologiques et leur lien avec les expressions génétiques. En gérant une large gamme de données morphologiques naturelles ou simulées, il comble une lacune qui a jusqu'à présent limité la compréhension quantitative de la morphodynamique et de ses fondements génétiques en contribuant à la création d'atlas morphologiques toujours plus nombreux.

Icy est une plateforme open source dédiée à l'analyse d'images biologiques. Il permet le traitement et la visualisation d'images microscopiques en 2D et 3D, ainsi que la calibration d'images. Il dispose d'un large éventail de plugins et de protocoles pour répondre aux besoins spécifiques de la recherche en biologie.

Ce projet est un outil d'analyse de séquences biologiques. Il permet de comparer des séquences et de calculer leur similarité. Cet outil est utile pour la recherche en biologie, la génomique et la bioinformatique.

Plugin Icy pour l'analyse d'intensité sur des pistes biologiques, développé par des membres ou anciens membres de l'unité BioImage Analysis de l'Institut Pasteur. Il s'agit d'un outil de traitement d'images dédié à la recherche en biologie, permettant le suivi de particules dans des séquences d'images.

Le projet Cluster est une plateforme dédiée à l'analyse de données biologiques. Il permet la gestion de workflows de recherche et l'automatisation de tâches de laboratoire, offrant ainsi une solution complète pour les chercheurs en biologie.