Plugin open source pour le logiciel Icy dédié à l'analyse d'images biologiques. Il permet aux chercheurs et biologistes de manipuler des matrices numériques et d'effectuer des calculs avancés directement dans l'environnement Icy. Développé par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, il s'intègre aux outils de bio-imagerie pour faciliter la recherche en biologie cellulaire et moléculaire.

Plugin pour le logiciel d'analyse d'images biologiques Icy, conçu pour traiter et analyser les trajectoires d'objets dans des séquences d'images microscopiques. Il permet de détecter, comparer et visualiser des mouvements cellulaires ou moléculaires, facilitant ainsi l'étude des dynamiques biologiques. Utilisé principalement en recherche biomédicale et en biologie cellulaire.

Orthoviewer est un plugin open source intégré au logiciel Icy, dédié à la visualisation et à l'analyse de données 3D en imagerie biologique. Il permet aux chercheurs et scientifiques d'explorer simultanément des données en trois orientations (XY, YZ, XZ) pour une analyse précise et détaillée. Développé par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, ce outil facilite la compréhension des structures cellulaires et moléculaires, soutenant ainsi la recherche fondamentale et appliquée en biologie.

JFree Chart est une bibliothèque dédiée à la création et à la visualisation de graphiques dans le domaine de l'analyse d'images biologiques. Intégrée au logiciel Icy, elle permet aux chercheurs et scientifiques de générer des représentations graphiques précises et personnalisables pour leurs données expérimentales. Utilisée principalement en imagerie médicale et biologique, elle facilite l'interprétation visuelle des résultats et soutient les travaux de recherche en biologie cellulaire et moléculaire.

Plugin pour le logiciel Icy dédié à l'analyse d'images biologiques. Il permet de traiter et d'extraire des séquences temporelles de trajectoires de particules ou d'objets biologiques, facilitant ainsi l'étude dynamique des phénomènes cellulaires ou moléculaires. Utilisé principalement en recherche biomédicale pour des applications comme le suivi de cellules ou de molécules.

Extension pour le logiciel d'analyse bioimage Icy, développée par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur. Elle fournit des outils pour détecter et suivre des points lumineux dans des images microscopiques, facilitant ainsi l'analyse quantitative de données biologiques. Utilisée principalement en recherche biomédicale pour étudier des phénomènes cellulaires ou moléculaires.

Plugin pour le logiciel Icy dédié à l'analyse d'images biologiques. Il permet de traiter et d'analyser les trajectoires d'objets (comme des cellules ou des particules) dans des séquences d'images microscopiques. L'outil facilite l'extraction de régions d'intérêt (ROI) et l'application de filtres pour affiner les données avant leur analyse quantitative. Utilisé principalement en recherche biomédicale pour étudier les mouvements cellulaires ou moléculaires.

Extension logicielle dédiée à l'analyse d'images biologiques, permettant de générer des vidéos de rotation à 360 degrés d'un volume 3D visualisé dans un logiciel de bioimagerie. Développée par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, elle s'intègre à Icy, une plateforme open source pour la recherche reproductible en imagerie cellulaire et moléculaire.

Outil dédié à la création de kymographes pour analyser les mouvements de régions d'intérêt dans des séquences d'images, notamment dans le cadre de l'étude du développement biologique. Il permet de tracer des rectangles sur des images ou vidéos, puis de générer une représentation graphique de l'évolution temporelle de l'intensité lumineuse le long d'un axe. Utilisé principalement en recherche biomédicale pour visualiser des dynamiques cellulaires ou moléculaires.

Ce projet centralise des outils open source dédiés à l'analyse d'images biologiques et microscopiques. Il propose des plugins et logiciels spécialisés pour faciliter le traitement, la visualisation et l'interprétation de données issues de microscopes. Développé par des instituts de recherche publics, il vise à standardiser et démocratiser l'accès à des méthodes avancées d'imagerie cellulaire et moléculaire.