Ce projet vise à intégrer des jeux de données de biologie végétale et des outils d'évaluation dans PubAnnotation, une plateforme d'annotation de texte. Cela permettra une analyse plus poussée des données et une évaluation de leur qualité, facilitant ainsi la recherche dans le domaine de la biologie végétale.

Outil dédié à l'analyse d'images confocal de plantes pour déterminer les limites en z des images 3D. Il permet de segmenter les structures biologiques, calculer les volumes cellulaires et générer des illustrations pour des publications scientifiques. Les scripts automatisent les étapes clés et produisent des résultats exploitables pour la recherche en biologie végétale.

Outil bioinformatique automatisé pour l'analyse de données de séquençage haut débit (CUT&Tag et DAP-Seq). Il permet d'identifier les régions génomiques liées à des protéines spécifiques, d'annoter ces régions, de comparer les profils d'expression entre échantillons et de visualiser les résultats dans des navigateurs génomiques comme IGV. Destiné principalement à la recherche en biologie végétale et génomique fonctionnelle.

Ce projet consiste en la curation et la gestion d'une base de données dédiée aux algues rouges (Rhodophyta), incluant des séquences génétiques (rbcl) et des métadonnées associées. Il vise à centraliser et structurer des données scientifiques pour faciliter la recherche en biologie marine et en systématique végétale. Les données sont organisées, vérifiées et documentées pour une utilisation par la communauté scientifique.

Plateforme publique dédiée à la découverte et à l'exploration de données scientifiques liées aux ressources génétiques végétales, aux collections de plantes et aux informations botaniques. Elle permet aux chercheurs, agronomes et professionnels du secteur agricole d'accéder à des bases de données fédérées, d'effectuer des recherches avancées et de visualiser des informations géolocalisées sur les ressources biologiques.