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Pertinence
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- Miniasm est un outil de reconstruction de génomes à partir de lectures longues, permettant l'assemblage de novo de séquences ADN. Il s'agit d'un logiciel open-source, souvent utilisé en combinaison avec minimap2 pour l'alignement de lectures longues. Cet outil est particulièrement adapté pour les projets de génomique, de biologie des systèmes et de recherche en génétique.
- Ce projet vise à rassembler et analyser les séquences du génome mitochondrial de différentes espèces de grenouilles. Il permet de comparer les séquences mitochondriales entre elles et avec des génomes nucléaires, ainsi que de concevoir des sondes pour la capture de séquences mitochondriales spécifiques. Ce projet est utilisé dans la recherche sur la diversité génétique des populations de grenouilles.
- Le projet gattlab est une plateforme dédiée à l'analyse de données génomiques. Il permet la recherche de variations génétiques, le développement d'outils de bio-informatique et la gestion de workflows de génomique. Il offre des fonctionnalités avancées pour les chercheurs et professionnels du domaine de la génomique.
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