Ce projet propose des ressources et outils pour la formation en biostatistiques, visant à soutenir les chercheurs, étudiants et professionnels de la santé dans l'analyse de données biologiques et médicales. Il facilite l'apprentissage des méthodes statistiques appliquées à la recherche biomédicale et encourage la collaboration entre équipes scientifiques.

Orthoviewer est un plugin open source intégré au logiciel Icy, dédié à la visualisation et à l'analyse de données 3D en imagerie biologique. Il permet aux chercheurs et scientifiques d'explorer simultanément des données en trois orientations (XY, YZ, XZ) pour une analyse précise et détaillée. Développé par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur, ce outil facilite la compréhension des structures cellulaires et moléculaires, soutenant ainsi la recherche fondamentale et appliquée en biologie.

JFree Chart est une bibliothèque dédiée à la création et à la visualisation de graphiques dans le domaine de l'analyse d'images biologiques. Intégrée au logiciel Icy, elle permet aux chercheurs et scientifiques de générer des représentations graphiques précises et personnalisables pour leurs données expérimentales. Utilisée principalement en imagerie médicale et biologique, elle facilite l'interprétation visuelle des résultats et soutient les travaux de recherche en biologie cellulaire et moléculaire.

Ce projet propose des matrices de données sur les interactions entre mammifères, destinées à des expériences scientifiques. Les fichiers téléchargeables contiennent des informations structurées pour analyser les relations entre espèces, utiles dans le cadre de recherches en écologie ou en biologie évolutive.

Application dédiée à la visualisation et à l'analyse de cartes de densité électronique issues de fichiers PDB et MTZ. Elle permet aux chercheurs et scientifiques d'explorer des données structurales biologiques, notamment dans le cadre de la recherche en biologie moléculaire et en cristallographie. Intégrée au Data Portal, elle facilite l'interprétation des structures moléculaires pour des études avancées.

Outil dédié à l'analyse d'images confocal de plantes pour déterminer les limites en z des images 3D. Il permet de segmenter les structures biologiques, calculer les volumes cellulaires et générer des illustrations pour des publications scientifiques. Les scripts automatisent les étapes clés et produisent des résultats exploitables pour la recherche en biologie végétale.

BLISS est une plateforme logicielle open source conçue pour la gestion et le contrôle d'équipements scientifiques, notamment dans les environnements de recherche comme les synchrotrons. Elle permet d'automatiser des processus expérimentaux, de superviser des instruments de laboratoire et d'analyser des données en temps réel pour faciliter les recherches avancées en physique, chimie ou biologie.

Sd_ngs est un projet dédié à la gestion et à l'analyse de données génomiques. Il permet aux chercheurs et scientifiques de stocker, organiser et analyser des séquences d'ADN, facilitant ainsi la recherche en biologie moléculaire et en génétique. L'outil favorise la collaboration entre équipes et améliore l'efficacité des études génomiques.

Ce projet développe un plugin pour la bibliothèque LImA, permettant de contrôler des détecteurs de type Mythen3 (détecteurs de rayons X en bande). Il facilite l'acquisition d'images, la configuration des paramètres d'acquisition (temps d'exposition, déclenchement externe) et l'intégration avec des systèmes de contrôle scientifique. Utilisé principalement dans des environnements de recherche, il standardise l'interfaçage avec ces équipements pour des applications en physique, biologie ou science des matériaux.

Otolithe est une application dédiée à l'analyse et à la datation des pièces calcifiées issues de poissons (écailles, otolithes, rayons de nageoires, etc.). Elle permet aux opérateurs de positionner des points précis sur des images de ces pièces et de consulter l'ensemble des mesures réalisées. L'outil facilite ainsi les études scientifiques et les recherches en biologie marine ou en gestion des ressources halieutiques.