CAMISIM est un logiciel permettant de modéliser des distributions d'abondance de communautés microbiennes et de simuler des jeux de données de métagénomique correspondants. Il a été principalement développé pour le défi [Critical Assessment of Metagenome Annotation (CAMI)](http://microbiome-cosi.org/cami) mais devrait être adapté à un usage général. N'hésitez pas à [ouvrir un nouvel issue](https://github.com/CAMI-challenge/CAMISIM/issues) si vous rencontrez des problèmes ou avez besoin d'aide.

Projet dédié à la création et à l'analyse de communautés microbiennes simulées pour évaluer des outils de classification taxonomique comme Kraken2. Permet de générer des jeux de données contrôlés afin de tester la précision et la robustesse des pipelines d'analyse métagénomique.

Ce projet fournit des documentations sur la génération de données simulées en métagénomique et sur l'utilisation de Sunbeam au Pasteur sur TARS. Il contient également des informations sur les projets de comparaison de systèmes de workflow (CWL, NextFlow et SnakeMake) et une bibliothèque Zotero pour les ressources liées à la métagénomique.

Ce projet vise à créer une base de données d'images de simulation pour le modèle SPE11B de l'OPM. Il utilise des outils tels que Damaris, OPM flow, HyperQueue et Ascent pour gérer et exécuter des workflows de simulations, et consolider les résultats dans des fichiers tar.gz.