Annuaire des initiatives

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  • Ce projet permet de convertir des fichiers de contraintes RMN au format CYANA en fichiers compatibles avec GROMACS, un logiciel de simulation de dynamique moléculaire. Il facilite la préparation de topologies pour les simulations de structures protéiques en intégrant des données de distance et des corrections de noms d'atomes ou de résidus. L'outil est particulièrement utile pour les chercheurs en biologie structurale ou en bioinformatique.
  • Getwatchan est un outil logiciel conçu pour identifier et analyser les canaux d'eau dans les simulations moléculaires dynamiques explicites. Il permet aux chercheurs en biologie structurale ou en bioinformatique d'isoler et de visualiser les chemins potentiels empruntés par les molécules d'eau au sein de structures protéiques. L'outil génère des fichiers de sortie exploitables pour étudier la dynamique des canaux hydriques, essentiels à la compréhension des mécanismes de transport dans les macromolécules biologiques.

2 initiatives