McpDiffusion est un serveur MCP développé par l'INSEE qui expose des données publiques françaises via un protocole standardisé. Il agrège trois sources majeures : les publications officielles, les jeux de données détaillés et les définitions conceptuelles de l'INSEE. Destiné aux modèles de langage (LLM), il permet d'interroger ces données de manière structurée et automatisée, offrant ainsi un accès unifié à des informations économiques, démographiques et sociales essentielles pour l'analyse et la recherche.

ADF (AGATA Data Format) est une bibliothèque autonome dédiée à la gestion des flux de données pour le projet AGATA, un système de détection en physique nucléaire. Elle permet d'encoder et décoder des trames standardisées à différents niveaux du traitement des données, facilitant l'interfaçage des algorithmes avec divers gestionnaires de workflows. Utilisée pour la simulation et l'analyse de données expérimentales, elle assure la compatibilité et l'interopérabilité des composants logiciels dans un environnement de recherche scientifique.

Ce projet vise à standardiser les données du Système National des Données de Santé (SNDS) au format OMOP-CDM, un modèle de données commun pour la recherche en santé. Il permet de transformer des extraits de données médicales (DCIR, PMSI, CépiDc) en une structure unifiée et interopérable, facilitant ainsi les analyses épidémiologiques et la recherche clinique. Deux versions sont disponibles, couvrant des périodes et des cohortes spécifiques.

Ce projet définit un schéma standardisé basé sur NeXus pour structurer les métadonnées brutes et traitées du portail de données de l'European Synchrotron Radiation Facility (ESRF). Il permet une gestion cohérente et interopérable des données expérimentales issues des recherches menées sur le synchrotron, facilitant ainsi leur analyse et leur partage au sein de la communauté scientifique.

Ce projet fournit un workflow automatisé pour préparer des génomes avant l'analyse de données de séquençage haut débit. Il standardise les données génomiques en générant des fichiers de configuration adaptés aux pipelines d'analyse bioinformatique. Le workflow permet d'intégrer des références génomiques spécifiques et de produire des structures de données compatibles avec les outils d'analyse en aval. Il est conçu pour être utilisé dans des environnements de recherche biomédicale, notamment dans des laboratoires spécialisés en génomique.

Ce projet développe un thésaurus central pour Data Terra, une infrastructure de recherche dédiée aux données environnementales. Il permet de standardiser et structurer les métadonnées liées aux observations scientifiques, en définissant des ontologies pour les types d'entités d'intérêt, les variables, les capteurs et les plateformes. L'objectif est d'harmoniser les données pour faciliter leur interopérabilité et leur réutilisation dans le cadre des principes FAIR (Faciles à trouver, Accessibles, Interopérables, Réutilisables).

Eds-scikit est un outil destiné aux data scientists travaillant sur le Data Warehouse Clinique de l'AP-HP. Il est spécifiquement conçu pour les données standardisées OMOP et a pour principaux objectifs de faciliter l'accès et l'analyse des données, de permettre un meilleur transfert de connaissances entre les projets et d'améliorer la reproductibilité de la recherche.

Librairie logicielle développée par l'INRAE dans le cadre de la plateforme 4P dédiée au phénotypage végétal. Elle facilite la gestion, la standardisation et l'échange de données issues d'images (LiDAR, RGB, multispectrales) utilisées en recherche agronomique. Elle propose également des outils pour valider les conventions de nommage et améliorer l'intégration des modules dans la plateforme 4P.

Ce projet centralise des outils open source dédiés à l'analyse d'images biologiques et microscopiques. Il propose des plugins et logiciels spécialisés pour faciliter le traitement, la visualisation et l'interprétation de données issues de microscopes. Développé par des instituts de recherche publics, il vise à standardiser et démocratiser l'accès à des méthodes avancées d'imagerie cellulaire et moléculaire.

Ce projet consiste à porter une bibliothèque de DAQ (Data Acquisition) vers le framework PID, facilitant ainsi l'intégration et la gestion de capteurs dans des environnements de recherche. Il permet aux développeurs d'utiliser des outils standardisés pour déployer et manipuler des bibliothèques logicielles dédiées à l'acquisition de données, notamment dans le cadre de projets scientifiques ou techniques.