Ce projet propose un catalogue de pipelines GitLab conçus pour simplifier et standardiser les processus d'intégration continue et de déploiement continu (CI/CD) sur la plateforme Cloud π Native (CPiN). Il offre des templates réutilisables pour construire des artefacts applicatifs, générer des images Docker, et déployer des applications via Helm, tout en garantissant une gestion sécurisée des secrets et des dépendances. Destiné aux équipes techniques, il permet d'accélérer le développement et le déploiement des applications tout en assurant une qualité de code optimale.

Pipeline bioinformatique automatisé conçu pour traiter des données ChIP-seq en simple extrémité chez l'humain. Il permet d'évaluer la qualité des échantillons, d'aligner les séquences, d'identifier les pics de liaison, et de générer des rapports détaillés. Le pipeline produit également des fichiers pour visualiser les résultats sur le navigateur génomique UCSC et inclut des métriques de qualité standardisées pour garantir la fiabilité des analyses.

Ce projet vise à éliminer les résultats de neuroimagerie non reproductibles, surnommés 'zombies', en promouvant l'utilisation de données ouvertes et de méthodes standardisées. Il propose des pipelines de pré-traitement, de contrôle qualité et d'analyse statistique accessibles à tous, afin de garantir la fiabilité et la réplicabilité des résultats scientifiques. L'objectif est de transformer les données brutes en ressources vivantes, vérifiables et partagées par la communauté.

Ce projet fournit un template et des outils pour générer automatiquement des projets Python structurés. Il facilite la mise en place de pipelines CI/CD, l'intégration d'outils de développement et de tests, ainsi que la standardisation des processus de développement. Idéal pour les équipes cherchant à accélérer la création de nouveaux projets tout en garantissant une qualité et une cohérence élevées.