Ce projet vise à comparer sept plateformes de séquençage, couvrant les technologies de deuxième génération à lecture courte (Illumina Hiseq300, DNBSEQ-G400, DNBSEQ-T7, Ion S5 et Ion Proton P1) et de troisième génération à lecture longue (Oxford Nanopore Technologies MinION et Pacific Biosciences PacBio). Trois communautés microbiennes synthétiques composées de jusqu'à 87 espèces microbiennes par mock et couvrant 29 phyla ont été utilisées pour l'évaluation. Les outils tels que fastp, AlienTrimmer, bowtie2, minimap2, SPAdes, metaFlye, metaquast et Python3 ont été utilisés pour le traitement et l'analyse des données.

Outil bioinformatique spécialisé dans l'assemblage de novo de génomes à partir de lectures longues et bruitées. Conçu pour traiter rapidement des données génomiques complexes, il permet aux chercheurs et laboratoires d'obtenir des séquences génomiques complètes et précises. Idéal pour les projets de séquençage à haut débit nécessitant une reconstruction fiable des génomes.