PARSEC est un outil statistique dédié à la correction des effets de batch et de cohortes dans les données d'intensité, notamment pour les jeux de données omics ou à haut débit. Il utilise des modèles linéaires mixtes (LMM) pour éliminer les variabilités indésirables introduites par les différences de traitement entre lots ou cohortes. L'algorithme applique une transformation logarithmique, une normalisation par lot, puis extrait les résidus corrigés pour obtenir des données comparables et fiables.

Ce projet automatise le téléchargement de lectures SRA depuis des bases de données génomiques, les convertit au format FASTQ et les stocke sur un bucket S3 dédié. Il utilise des infrastructures cloud (AWS Batch) pour exécuter des traitements par lots, permettant aux chercheurs de traiter efficacement de grandes quantités de données génomiques sans intervention manuelle.

Bmc-tools est un outil en ligne de commande permettant d'analyser et d'extraire des données bitmap à partir de fichiers Windows spécifiques, tels que les fichiers bcache*.bmc et cache????.bin. Il offre des fonctionnalités telles que le traitement par lots, la vérification de l'existence du dossier de destination, l'extraction d'un nombre défini de bitmaps, et la génération d'une image bitmap agrégée.

Myria3D est une bibliothèque de deep learning conçue pour la segmentation multiclasse de grands nuages de points Lidar à haute densité. Elle implémente l'entraînement de réseaux de neurones de segmentation 3D avec des logiques de traitement et d'évaluation optimisées pour les données à l'échelle du lot. L'inférence sur des nuages de points inconnus à grande échelle est également prise en charge, ce qui permet d'évaluer la IoU sur l'ensemble du nuage de points, ce qui se traduit par une évaluation fiable du modèle.

Ce projet est un traitement par lots (batch) conçu pour extraire, transformer et exporter des notices bibliographiques issues de la base de données Sudoc. Il génère des fichiers CSV contenant les titres, résumés et sujets RAMEAU associés, tout en éliminant les doublons. Ces fichiers sont ensuite transmis à un module de vectorisation pour alimenter une base de données vectorielle dédiée à l'indexation sémantique des documents.

Ce plugin permet d'importer des identités en masse dans une base de données IdentityStore via un service REST. Les identités sont traitées pour être insérées dans la base de données, soit automatiquement, soit rejetées si une identité similaire existe déjà, soit mises en attente pour un traitement manuel. Le plugin retourne l'identifiant unique (CUID) de l'identité insérée en tant que résultat du lot.

FrameAccumulation est un outil conçu pour optimiser et analyser l'accumulation de frames vidéo à partir de flux ou de fichiers. Il permet d'extraire des métadonnées visuelles, de traiter des séquences vidéo par lots et d'améliorer l'efficacité des analyses vidéo. Idéal pour les professionnels de la vidéo, du montage ou de la surveillance, il simplifie la gestion et l'exploitation des données visuelles.

Le projet repository-public est une bibliothèque de modules et d'images Docker fournissant des fonctionnalités de gestion et d'utilisation de données géospatiales. Elle permet de créer des cartes interactives et d'exécuter des traitements par lots.

Ce projet permet d'orchestrer et de gérer des tâches de calcul distribuées via un cluster Bacalhau, en utilisant une API Fastify pour interagir avec les nœuds. Il stocke les résultats des calculs dans un système MinIO, facilitant ainsi l'accès et l'analyse des données produites. Idéal pour des workflows scientifiques ou des traitements par lots nécessitant une infrastructure scalable et fiable.