Ce projet consiste en la standardisation de la base principale du Système National des Données de Santé (SNDS) au format OMOP-CDM (Observational Medical Outcomes Partnership Common Data Model). Il contient des scripts SQL sous forme de projet DBT qui permettent d'extraire, de transformer et de charger les données du DCIR, du PMSI, des référentiels médicalisés et des référentiels EHPAD dans une base de données Postgres.

SCALPEL-Flattening est une bibliothèque open source conçue pour transformer et optimiser les données du Système National des Données de Santé (SNDS) en France. Elle permet de convertir des fichiers CSV en formats compressés comme Parquet, puis de les fusionner en tables unifiées pour faciliter l'extraction de concepts médicaux. Ce processus accélère l'analyse des données de santé tout en réduisant leur volume, rendant les bases de données plus accessibles et exploitables pour la recherche et les études épidémiologiques.