GAPeDNA est une interface web permettant de visualiser les lacunes actuelles dans la couverture des espèces dans les bases de données d'eDNA métabarcoding. L'application utilise une base de données de référence EMBL et permet aux utilisateurs de choisir le groupe taxonomique, la résolution spatiale et la position du marqueur pour afficher la couverture des espèces sur une carte interactive.

Ce workflow offre une analyse automatisée des données microbiomes, en commençant par des marqueurs taxonomiques séquencés (tels que 16SrRNA) et en utilisant le boîtier à outils QIIME2 standard pour produire une table d'abondance et une analyse de diversité, phylogénie et taxonomie préliminaire.