Outil spécialisé dans l'évaluation et la classification de structures protéiques complexes. Il calcule des métriques d'assessment couramment utilisées en biologie structurale, comme les scores CAPRI, DockQ et l-DDT. Permet de valider la qualité des modèles de docking moléculaire pour des complexes impliquant peptides, acides nucléiques ou oligosaccharides, en fournissant une analyse quantitative et une classification selon des critères standardisés.

VoroCNN est un réseau de neurones convolutifs conçu pour analyser les structures protéiques 3D à partir de leur tessellation de Voronoï. Il prédit des scores locaux et globaux pour évaluer la qualité des modèles de protéines, aidant ainsi les chercheurs en bioinformatique à valider et comparer des structures moléculaires complexes.

PPIDM est une approche développée par Zia Alborzi pour inférer des interactions entre domaines protéiques à partir de plusieurs sources de PPIs. Les résultats sont validés à l'aide d'un Gold-Standard extrait de bases de données structurales 3D. Les interactions sont catégorisées et comparées avec des jeux de données existants.