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Pertinence
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- Outil dédié à l'analyse et au traitement de données taxonomiques virales issues de résultats BLAST et de tables de comptage. Il permet de filtrer, regrouper et fusionner des données pour préparer des analyses en aval comme la visualisation ou les tests statistiques. Basé sur des algorithmes de propagation de labels et de clustering, il identifie des groupes de contigs viraux partageant des profils similaires.
- Ce projet automatise le benchmarking des performances des environnements HPC basés sur Guix, notamment pour les clusters comme Plafrim. Il exécute des tests de bande passante MPI entre nœuds, compare différentes configurations (MPI, réseaux) et stocke les résultats dans une base de données. Les données sont ensuite analysées pour détecter des régressions et visualisées sous forme de graphiques. L'objectif est d'optimiser les performances des infrastructures de calcul haute performance.
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