Le Bioimaging Desktop est une plateforme dédiée à l'analyse et à la visualisation d'images biologiques et microscopiques. Elle fournit aux chercheurs et scientifiques des outils spécialisés pour manipuler, analyser et interpréter des données d'imagerie issues de divers domaines comme la biologie cellulaire, la pathologie numérique ou la bioinformatique. Intégrée à l'écosystème Biosphère, elle facilite la gestion et le partage de données d'imagerie complexes.

Ce projet propose une formation pratique en analyse d'images biologiques pour les scientifiques du vivant. Il couvre les bases du traitement d'images microscopiques, la segmentation, la normalisation et l'extraction de caractéristiques cellulaires. Les participants apprennent à construire des pipelines d'analyse automatisés et à visualiser les résultats. Les supports pédagogiques incluent des notebooks Jupyter et des jeux de données issus du Human Protein Atlas.

Le plugin Google Gson pour Icy est une bibliothèque permettant la gestion et l'analyse d'images biologiques. Il offre des fonctionnalités de traitement et de visualisation d'images, ainsi que la gestion de données associées. Développé par des membres ou anciens membres de l'unité BioImage Analysis de l'Institut Pasteur, ce plugin est distribué sous licence GPL3.

Extension logicielle conçue pour enrichir les fonctionnalités du logiciel Icy, dédié à l'analyse d'images biologiques. Elle permet aux chercheurs et biologistes d'étendre les capacités de traitement et de visualisation des images microscopiques, facilitant ainsi l'analyse avancée des données bioimage dans un cadre académique ou industriel.

Montage 2D est un plugin pour le logiciel d'analyse bioimage Icy, développé par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur. Il permet aux chercheurs et biologistes de créer des montages d'images 2D à partir de données microscopiques, facilitant ainsi l'analyse et la visualisation de leurs échantillons biologiques. Le plugin s'intègre directement dans l'écosystème Icy, offrant une solution open source et collaborative pour la recherche en imagerie médicale.

Formation organisée par des organismes publics (CNRS, France BioImaging, EMBRC-France) pour enseigner l'utilisation d'OMERO, un système de gestion d'images biologiques. Les participants apprennent à importer, visualiser, annoter et partager des données d'imagerie scientifique tout en respectant les principes FAIR (Faciles à trouver, Accessibles, Interopérables, Réutilisables).

Le projet kinect-driver est un plugin pour le logiciel bioimage Icy, permettant la capture de données de mouvement humain à l'aide d'une caméra Kinect. Il offre une visualisation 3D des squelettes et permet une intégration facile avec Icy.

Ce projet permet d'analyser et de visualiser des données météorologiques et environnementales liées aux risques d'incendie de forêt en Algérie. Il exploite un jeu de données détaillé incluant température, humidité, vitesse du vent et précipitations pour évaluer les conditions propices aux départs de feu. Les utilisateurs peuvent explorer ces données pour mieux comprendre les facteurs influençant les incendies et contribuer à leur prévention.