Bibliothèque Python dédiée à la manipulation et à l'analyse de données organisées en arborescences. Elle propose des fonctionnalités de réduction de graphes en arborescences, de visualisation de données à l'aide de Matplotlib et NetworkX, ainsi que des algorithmes de classification de données en arborescences basés sur scikit-learn.

Le package ViSEAGO est un outil développé en R pour faciliter l'analyse fonctionnelle des gènes en utilisant Gene Ontology (GO). Il permet l'analyse de grands jeux de données et la visualisation des profils GO pour capturer les connaissances biologiques. Il offre une vue synthétique et détaillée en utilisant des fonctionnalités interactives tout en respectant la structure de l'arborescence GO.

Galaxy-tools est un outil permettant la visualisation et l'interaction avec des arborescences de données. Il offre des fonctionnalités de recherche, de navigation et de personnalisation de l'affichage, facilitant la compréhension et l'analyse de structures de données complexes.

Outil de base pour enquêter sur les calculs OpenFisca, permettant l'analyse et la visualisation d'arborescences de données ainsi que l'investigation de variables dans les calculs.

Tangotree est un outil de visualisation et de gestion d'arborescence de données. Il permet de filtrer les données par attributs et de sélectionner les sources de données.

Le projet theia-ecore-editor est un éditeur d'arborescences de données réfléchissant pour Theia, basé sur ModelServer. Il permet la visualisation et l'édition de modèles métiers.