Annuaire des initiatives
Pertinence
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- Beast est un outil d'analyse de données génétiques permettant d'inférer la taille de population au fil du temps et la dynamique démographique des populations. Il prend en entrée des fichiers de données génétiques et produit des visualisations et des résultats d'inférence sous forme de fichiers de sortie.
- Le package R 'sameStrain' est un outil dédié à l'analyse et à la simulation de données génétiques de bactéries. Il permet de calculer des statistiques sur les données, de simuler des événements de mutation et de recombinaison, et de visualiser les résultats grâce à des graphiques générés avec ggplot2.
- Ce projet est une application web développée avec Shiny, un framework pour R, permettant de visualiser et d'analyser des données sur la diversité génétique des poissons marins. Il offre une cartographie interactive de la répartition des espèces de poissons et permet de réaliser des analyses approfondies sur ces données.
- Notoriété 7 %MorphoNet est un navigateur web innovant permettant de visualiser et d'interagir avec des ensembles de données morphodynamiques complexes, avec des applications dans la recherche et l'enseignement. MorphoNet offre un large éventail d'interactions pour explorer la structure, la dynamique et la variabilité des formes biologiques et leur lien avec les expressions génétiques. En gérant une large gamme de données morphologiques naturelles ou simulées, il comble une lacune qui a jusqu'à présent limité la compréhension quantitative de la morphodynamique et de ses fondements génétiques en contribuant à la création d'atlas morphologiques toujours plus nombreux.
- Ce projet contient des scripts et des données utilisés dans l'analyse et la visualisation de l'article « Trait selection strategy in multi-trait GWAS: Boosting SNPs discoverability ». Il permet d'évaluer les associations entre des traits cliniques et des variantes génétiques, de calculer les corrélations génétiques entre les traits, et d'estimer l'héritabilité de chaque trait.
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