D-GENIES est un outil open source permettant de comparer de grands jeux de séquences génomiques via des dot plots interactifs. Il génère des visualisations synthétiques pour identifier les répétitions, les ruptures et les inversions dans les génomes. L'application permet de trier les séquences, zoomer sur les graphiques et exporter des fichiers d'alignement ou de séquences au format image ou texte.