Annuaire des initiatives
Pertinence
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- Amazon ECR
- Ce projet automatise la construction d'unités de contigs (unitigs) ou de contigs à partir de données génomiques en utilisant des outils comme BCALM ou Minia. Il s'appuie sur une infrastructure AWS pour orchestrer le traitement des données via AWS Batch, en déclenchant des calculs dès qu'un fichier est déposé dans un bucket S3. L'objectif est de simplifier et accélérer l'analyse de séquences génomiques pour des applications en bioinformatique.
- Ce projet automatise la construction de contigs viraux à partir de données génomiques en utilisant des outils comme Minia/coronaSPAdes et CheckV. Il s'appuie sur AWS Batch pour orchestrer des tâches de calcul intensif dans le cloud, permettant aux chercheurs de traiter rapidement et efficacement de grandes quantités de données génomiques sans gérer manuellement l'infrastructure.
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