Comparative Genomics
Ce projet propose un pipeline computationnel pour analyser les relations de synténie entre génomes de différentes espèces. Il permet d'identifier les orthogroupes (groupes de gènes issus d'un même ancêtre commun) et de construire des arbres phylogénétiques. Le pipeline intègre des outils pour aligner des séquences génomiques, détecter des blocs synteniques et visualiser les résultats via des outils comme Synvisio et Jbrowse. Il est particulièrement utile pour les chercheurs en génomique comparative travaillant sur des espèces végétales ou animales.
Cas d'utilisation métiers
- Construction d'arbres phylogénétiques : rechercher des initiatives proches
- Alignement de séquences génomiques : rechercher des initiatives proches
- Analyse des relations de synténie génomique : rechercher des initiatives proches
- Visualisation de blocs synteniques : rechercher des initiatives proches
- Détection d'orthogroupes entre génomes : rechercher des initiatives proches
Description générée le jeudi 12 novembre 2026 à 14:33:21