wgrr
Notoriété 7 %
GRIS est un outil bioinformatique conçu pour calculer des indices de similarité entre ensembles de gènes ou de protéines. Il permet d'évaluer la parenté entre deux jeux de données protéiques en utilisant des méthodes comme le wGRR (weighted Gene Repertoire Relatedness), le coefficient de Sørensen-Dice ou l'indice de Jaccard. Ces calculs reposent sur l'identification de paires de protéines réciproquement les meilleures (BBH) via des analyses de type BLAST. L'outil est particulièrement utile pour comparer des génomes, des prophages ou des ensembles de protéines dans un contexte de recherche génomique ou évolutive.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Identification de protéines homologues : rechercher des initiatives proches
- Mesure de similarité génétique : rechercher des initiatives proches
- Calcul d'indices de similarité entre ensembles de gènes : rechercher des initiatives proches
- Analyse comparative de protéomes : rechercher des initiatives proches
- Évaluation de la parenté entre génomes : rechercher des initiatives proches
Cas d'utilisation fonctionnel
Outil utilisé
Description générée le jeudi 12 novembre 2026 à 19:56:25