methylOnt
Ce projet vise à comparer plusieurs outils permettant d'identifier les cytosines méthylées dans des données fast5. Après avoir exécuté ces outils sur un jeu de données test d'Arabidopsis thaliana, une analyse comparative a été réalisée en termes de détection par sites. Il a été conclu que DeepSignalPlant était le plus performant. Ce dépôt contient des scripts permettant d'exécuter DeepSignalPlant et de générer des statistiques à partir de ses résultats.
Cas d'utilisation métiers
- Identification de cytosines méthylées dans des données fast5 : rechercher des initiatives proches
- Génération de statistiques à partir des résultats de DeepSignalPlant : rechercher des initiatives proches
- Analyse comparative de différents outils de détection de méthylation : rechercher des initiatives proches
Cas d'utilisation fonctionnel
Organisation
- Institut de recherche pour le développement (organisation rattachée)
Description générée le lundi 18 mars 2024 à 00:18:59
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