Ce projet est issu d'un hackathon en data science. Il fournit des ressources pour l'analyse et la visualisation de données, ainsi que des tutoriels pour le développement d'applications web interactives et l'initiation à l'apprentissage automatique, en utilisant les langages R et Python.

Présentation de Git, un système de contrôle de version décentralisé, permettant la gestion et la collaboration sur des projets de développement de logiciels. Il permet de suivre l'historique des modifications de code, de gérer les conflits et de travailler en équipe de manière efficace.

Easy16S est une application web interactive conçue pour faciliter l'exploration, la visualisation et l'analyse de données de microbiome. Elle est construite sur le package R phyloseq et ses extensions, et est intégrée à la suite de traitement de séquences FROGS.

Le projet dockerize_MATRiX permet l'analyse et la visualisation de données mathématiques à l'aide d'applications Shiny. Il s'appuie sur Docker pour faciliter l'installation et la gestion des dépendances.

Le package Shiny permet de créer des applis web interactives à partir de scripts R. Lors de cet atelier, nous découvrirons ensemble les principes de bases de Shiny et vous accompagnerons avec un tutoriel pratique. Pour celles et ceux qui le souhaitent, nous aborderons également les solutions de déploiement d'appli Shiny grâce aux solutions shinyapps.io et ShinyProxy (docker).

Analyse de l'exposition prénatale aux perturbateurs endocriniens et son impact sur le développement fœtal.

Le projet optimas est une application permettant l'analyse et la prédiction de caractéristiques génétiques à partir de données fournies par l'utilisateur. Il offre des fonctionnalités de visualisation de données et de résultats sous forme de graphiques et de tableaux.

Le projet RECORD est une application web dédiée à la simulation de la croissance de plantes en fonction de données météorologiques. Il permet de calculer la biomasse et le rendement de cultures en utilisant des modèles sophistiqués.

Facundo Muñoz September 05, 2022 Modelling SIT trials. - [Working document (HTML)](https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/sit-methods/sit-methods.html) [[PDF](https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/sit-methods/sit-methods.pdf)] - [Simulation study (HTML)](https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/sit-methods/simulation_study.html) - [Simulation animation (GIF)](https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/sit-methods/sim_animation.gif)

Outil développé sur la base de Shiny pour faciliter l'analyse de données biologiques et la visualisation interactive de résultats dans un contexte de bioinformatique.