Ce projet est une formation et un accompagnement au Calcul, au Cloud et à Kubernetes, qui se déroule à Sète en 2023. Il a pour but de présenter les possibilités offertes par les images Singularity et de fournir des tutoriels pour l'installation, la création et l'utilisation de ces images. Il aborde également l'utilisation de Conda dans un container Singularity et la création d'image pour exécuter du code MPI.

Ce projet fournit des modèles Gitlab CI utiles pour la construction et le déploiement d'images Docker, la gestion des dépendances du projet et la vérification de la qualité du code et des résultats des tests.

Ce projet fournit des images Docker pour les projets URGI GnpIS, y compris une image pour déployer des synonymes DataDiscovery dans un cluster Elasticsearch et une image utilisée par Gitlab CI pour construire les projets data-discovery et Faidare. Il contient des outils tels qu'ImageMagick, rsync, Java, Chrome, Firefox, curl et GNU parallel.

Le projet Bac à sable - EFNO est une plateforme dédiée à la gestion de projets de recherche et au partage de données entre équipes. Il permet aux utilisateurs de téléverser des fichiers, de travailler en collaboration et de gérer leurs projets en toute simplicité. Cette plateforme est également un espace d'expérimentation et de développement de logiciels, offrant ainsi un environnement flexible et adapté aux besoins des chercheurs et des développeurs.

Ensemble de programmes effectuant des opérations sur les fichiers SAM/BAM, regroupés dans un exécutable unique et intégrés dans un conteneur Singularity.

Le projet bedloadweb est une application R-Shiny dédiée à l'analyse, la visualisation et la simulation de processus géologiques, en particulier le transport sédimentaire dans les lits de rivière. Il offre une interface conviviale pour interagir avec des données complexes et des modèles sophistiqués, permettant aux utilisateurs de mieux comprendre et prédire les phénomènes liés à l'érosion et au dépôt des sédiments.

Documentation HTML sur la gestion des données à l'UREP, compilée avec bookdown et hébergée sur GitLab Pages.

"cdna\_cupcake est un ensemble d'outils en Python et R pour l'analyse de données de séquençage. La plupart des scripts nécessitent seulement Biopython. Les scripts nécessitant des bibliothèques supplémentaires seront spécifiés dans la documentation."

Checkmk est un outil de surveillance des systèmes informatiques permettant de superviser l'état de santé des équipements réseau, des serveurs et des applications. Il offre une détection proactive des pannes et des anomalies, ainsi qu'une gestion de la performance des réseaux. Checkmk automatise également les tâches d'administration système, facilitant ainsi le travail des équipes informatiques.

Enquete-datapapers est une plateforme dédiée à la collecte, la gestion et l'analyse de données provenant de sondages et d'enquêtes. Elle permet de créer des questionnaires personnalisés, de collecter les réponses de manière sécurisée et de générer des rapports d'analyse détaillés.