Ce projet permet de créer une machine virtuelle sous Windows 10 avec un environnement R et Rtools préinstallés, ainsi que d'autres dépendances. La machine virtuelle est ensuite enregistrée en tant que runner GitLab pour être utilisée dans des pipelines CI/CD.

Ce projet est un ensemble de scripts R dédié à la calibration de modèles écologiques complexes en utilisant la méthode ABC-RF-SA, qui combine l'Approximate Bayesian Computation (ABC), le Random Forest et l'analyse de sensibilité. Il fournit des scripts pour la génération de statistiques sommaires, la sélection de la meilleure simulation, l'analyse de sensibilité, et la calibration via ABC, ABC-RF et ABC-RF-SA.

Ce projet propose la résolution numérique d'un processus markovien déterministe par morceaux (PDMP) décrivant le renouvellement des cellules épithéliales dans la cryptes intestinales. Il permet de générer des figures illustrant les résultats de simulations en fonction de différents paramètres et conditions initiales.