Le logiciel beads permet l'analyse d'images de gels d'électrophorèse 2-D en détectant et en quantifiant les taches présentes sur ces images. Il est utilisé pour la reconnaissance de motifs sur des images de gels, ce qui permet d'identifier et de quantifier les protéines présentes dans l'échantillon.

Ensemble d'outils utiles pour la spectrométrie de masse et la protéomique, utilisés par l'équipe PAPPSO (http://pappso.inra.fr/). Il permet de générer des tables d'ions à partir de peptides, des dessins SVG de spectres de masse annotés, le calcul des rapports d'intensité attendus des isotopes à partir d'un peptide, etc.