Annuaire des initiatives
Pertinence
Vous ne trouvez pas l'initiative qui correspond à votre besoin ? Notre assistant peut vous aider.
- Institut de recherche pour le développement
- NumPy
- Notoriété 10 %Le projet culebront_pipeline est dédié à l'assemblage et l'analyse de génomes à partir de lectures longues. Il offre des fonctionnalités d'analyse et de visualisation de données génomiques, permettant une meilleure compréhension des données et facilitant la prise de décision dans le domaine de la génomique.
- Notoriété 10 %RattleSNP est un projet dédié à l'analyse de données génomiques, proposant un workflow snakemake pour le mapping de données simples ou appariées. Il offre des fonctionnalités de visualisation de données biologiques grâce à matplotlib et tabulate, ainsi qu'une gestion optimisée des dépendances grâce à biopython, numpy et pandas.
- Notoriété 7 %PodiumASM est une pipeline Snakemake open-source, évolutive, modulable et traçable, conçue pour comparer plusieurs assemblages de génomes à longues lectures obtenus à partir de divers outils d'assemblage. Ce workflow permet de choisir le meilleur assemblage parmi toutes les possibilités.
- FOTOTEX est une implémentation Python de l'algorithme FOTO permettant la caractérisation et la comparaison de textures. Il s'agit d'une méthode d'ordonnancement textural basée sur la décomposition spectrale de Fourier, décrite dans l'article de Pierre Couteron, Nicolas Barbier et Denis Gautier en 2006.
- PyRasta est une petite bibliothèque Python qui vise à faciliter l'utilisation des fonctions et méthodes GDAL. Elle permet aux utilisateurs de se concentrer sur les processus qu'ils souhaitent appliquer plutôt que sur le code. La bibliothèque utilise GDAL stream et multiprocessing pour réduire le temps CPU dû aux importations de grandes matrices numpy. Cela est particulièrement utile pour les opérations arithmétiques de base sur les rasters, les méthodes de fenêtre glissante et les statistiques zonales.
12 initiatives
10